Membre de la Commission d'exploration du Mékong (1866-1868) dirigée par Doudart de Lagrée et dont le photographe est Émile Gsell. Benjamin et seul civil de la mission, il est à l'écoute du gouverneur et entre souvent en conflit avec les autres membres de l'expédition, du fait de sa position particulière. Il est chargé de la partie descriptive du voyage et plus particulièrement des renseignements commerciaux. Gravement malade à son retour, il ne peut achever la rédaction de ses notes de voyage. Après sa mort, c'est son père, Louis de Carné (1804-1876), homme politique et membre de l'Académie française, qui se charge de la préface et de la publication de son récit de voyage en 1872. Cet ouvrage fut aussitôt traduit et édité en anglais.